1.凍藏法：利用逐漸降低的氣溫使入貯的菠菜逐漸適度凍結，并在凍結的狀態下凍藏直至上市。具體做法是在風障、房屋或院墻北側遮陰部位做與風障方向相同的菜畦，畦深同菠菜高，將經扎捆預冷的菠菜在畦中順向碼兩排，中間留約15厘米空隙，菜捆間不要靠的太緊，以利通風散熱。然后在菠菜上覆一層細土或細砂，以后隨天氣漸冷，逐步覆土保持凍結狀態，以不化不能深凍為度。 
 
    同時在背陰處順向挖一條或數條凍藏溝，僅能放兩排菠菜的窄溝下面可不設通風道。放8—12排菠菜的寬溝下面需挖設約20厘米深寬，兩端與地面相通的通風溝，將菠菜捆根朝下排在溝內后，上面覆蓋一層秸稈，以利保濕，待天氣漸冷，菠菜輕度凍結后隨氣溫逐降而分次覆蓋細土或細砂，保持溝內-2—-4℃的低溫。 
  
    上市前應取出菠菜放在2℃左右條件下緩慢解凍，凍結狀態的菠菜，在搬運過程中，應注意避免擠壓碰傷。
   
    2.袋裝自發氣調冷藏法：將收獲后經過整理的菠菜捆成0.5—1.0公斤的菠菜把，經過散熱預冷后，裝入0.06—0.08毫米厚，110×80厘米規格的聚乙烯薄膜袋中，葉片相對，根朝袋兩端，每袋約15—20公斤，送到冷庫菜架上平放，敞口再預冷一晝夜，然后用一直徑約2厘米的圓棒插入袋口扎緊，再拔出圓棒，或松扎袋口，并使袋內留有較大空隙，封袋后置入-1—1℃溫度，90%—95%相對濕度的冷庫中，靠袋內菠菜自發代謝活動吸氧排碳作用，可逐漸形成一個較低氧，較高二氧化碳的氣體環境，同時內部濕度條件好，可保鮮2—3個月，損耗不大。